אוסף גדול ומגוון של כחמישים ספרי ראשונים ומדרשים, חלקם במהדורות מוערות ומדעיות, שנדפסו על פי כתבי-יד עתיקים. רבים מהספרים ראו אור לראשונה במהדורות שלפנינו:
• ספר מלכיאל, ביאורי אגדות וחידות בתלמוד בדרך הקבלה, מאת רבי מלכיאל חזקיה בן אברהם. זולקווא, [תקנ"ט 1799]. חתימת וחותמת רבי מרדכי ב"ר יעקב פרידמן ממזריטש – הגאון רבי מרדכי פרידמן ממזריטש דליטא, בעל "מעורר ישנים" (ורשא תרפ"ו) וקונטרס "פותח דברים" [נדפס בסוף שו"ת אהל משה, ורשא תרמ"ט 1889; דבריו בקונטרס זה הובאו בספרי הפוסקים, ואפילו בעל ה"משנה ברורה", שלא היה רגיל להביא מדברי רבני דורו, מביא בשמו פסק הלכתי בביאור הלכה, סימן רעג, ד"ה לאלתר]. (למידע נוסף אודותיו, ראו ר"א הכהן כ"צמאן, 'הגהות לספר שם הגדולים', ישורון, שנת תש"ע, כרך כג, עמ' תרכה-תרלה).
• ספר אוצר נחמד, והוא חדושי הרמב"ן על מסכת שבת, על פי כתב-יד נושן, בעריכת רבי יעקב אורנשטיין אב"ד לבוב והגליל. פרשבורג, [תקצ"ז] 1837. עם הסכמת רבי משה סופר אב"ד פרשבורג בעל ה"חתם סופר".
• ספר ספרא, הנקרא תורת כהנים, חלק ראשון, עם ברייתא די"ג מדות, ופרשת ויקרא, עם פירוש "עזרת כהנים" ו"תוספות העזרה", מאת רבי צבי הירש הכהן רפופורט מדובנא. וילנא, תר"ה, 1845.
• ספר ספרא, הנקרא תורת כהנים, עם פירוש "עזרת כהנים" ו"תוספות העזרה", מאת רבי צבי הירש הכהן רפופורט מדובנא. חלק שני על פרשת צו. זיטאמיר, דפוס רבי אברהם שלום שאדאוו, תרכ"ו, 1866.
• תשובות גאונים קדמונים, מאת רבינו יוסף טוב עלם, מהדורת דוד קאססעל, עם מבוא מאת הרב שי"ר רפופורט. ברלין, תר"ח, 1848.
• ספר דברי חכמים, כולל אחד עשר ספרים ישנים ועתיקים, בערכית רבי אליעזר אשכנזי איש פולין תושב בוניס הבירה. מיץ, תר"ט [1849].
• ספר מורה נבוכים, מאת הרמב"ם, חלק ראשון, עם הערות מאת ד"ר שמעון שייער. לונדון, תרי"א, 1851.
• ספר נחל קדומים – נחלת יעקב, כתבים שונים בעריכת יהודה ליב דוקעס, מחברת ראשונה ושנייה. הנובר, תרי"ג [1853].
• ספר טעם זקנים, חיבורי קדמונים בענייני חכמה ומדע, מאת אליעזר אשכנזי. פרנקפורט דמיין, תרט"ו, 1854.
• שירי שלמה, שירים יקרים מהחכם המשורר ר' שלמה בן גבירול ז"ל, יוצאים לאור ע"י יהודה ליב דוקעס. הנובר, תרי"ח [1858].
• ספר האשכול, מאת רבי אברהם מנרבונה, חותנו ורבו של הראב"ד, יוצא לאור על ידי רבי צבי בנימין אויערבאך. הלברשטאט, תרכ"ח-תרכ"ט, 1868-1869. שלושה חלקים בכרך אחד. כריכת עור מקורית, עם עיטורים מוזהבים.
• ספר מכילתא דרבי ישמעאל, על ספר שמות, עם תוספות מאיר עין, ועם מבוא, מאת רבי מאיר איש שלום. וינה, תר"ל, 1870. בדפי השער חתימות של החוקר נחמיה שמואל ליבאוויטש.
• כתאב אלרסאייל, ספר אגרות הרמ"ה, מתורגם לעברית, מאת רבינו מאיר הלוי בן טודרוס הלוי אבולעפיה, עפ"י כתב-יד מספריית יוזל גינצבורג, יוצא לאור על ידי יחיאל ברי"ל. פריז, תרל"א [1871].
• ספר נוה שלום, חלק א' על פי כתב-יד מאוצר הספרים של מלך ביירען במינכן, כולל כתב-יד של אבות דרבי נתן, שהובא לארץ-ישראל, בעריכת רבי שלמה. מינכן, תרל"ב [1872].
• אגרת מוסר ששלח כמוהר"ר שלמה אלעמי ז"ל לתלמידו מפורטוגאל בשנת הקע"ה ליצירה. וינה, תרל"ב [1872].
• ספר קורא באמת, מאת רבי יצחק דוב במברגר אב"ד ווירצבורג. חלק ראשון – על דרשות "אל תקרי" שבש"ס, פראנקפורט דמיין, דפוס ה. ל. בראננער, תרל"א [1871]; חלק שני על דרשות אל תקרי שבמדרש תנחומא, מאינץ, תרל"ח [1878]. שני החלקים בכרך אחד.
• בית המדרש, "בו אסיפת מדרשים קטנים ומאמרים שונים ישנים", חדר ראשון עד חדר ששי, בעריכת אהרן יעלינק. לייפציג-ווינה, דפוסים שונים, תרי"ג-תרל"ח, 1853-1878. ששה כרכים (סט שלם). קובץ של מדרשים, חיבורים קבליים ומעשיות, מספרות חז"ל ועד ספרות ימי הביניים, עם מבואות בגרמנית. דף השער העברי בכרך השני חסר. בכרך הראשון דף עם הערות בכתב-ידו של החוקר נחמיה שמואל ליבאוויטש.
• ספר הרוקח, לרבי אלעזר מגרמיזא. וורשא, תר"מ, 1880. חותמות, רישומים וחתימות הגאון רבי ברוך עסמאן מקיוב (בעל "חד וחלק").
• ספר משפחת סופרים, על המסורה, מאת שמואל בן בנימין וואלף מוויטעבסק. ווילנא, תרמ"ג, 1883.
• מסכת אבות דרבי נתן, בשתי נוסחאות, על פי כתבי-יד, עם מבוא ומפתחות מאת שניאור זלמן שעכטר. וינה, תרמ"ז [1887]. בדף השער השני הקדשה בכתב-ידו של המחבר, לנחמיה שמואל ליבאוויטש, ובדף המגן הועתק הרישום על מצבתו של שעכטר.
• ספר מתת-יה, באורים, הגהות, והערות מאירות למדרש רבה, מאת רבי מתתיהו שטראשון, עם זכרון לחכם על תולדותיו, וקונטרס שירי מנחה, מאת רבי שלום פלאדירמאכער. ווילנא, תרנ"ג, 1893. עם פורטרט המחבר.
• אגרת רב שרירא גאון, יוצאת לאור על פי כתבי-יד שונים, עם תיקונים והערות מאת דוב בער גולדברג. מיינץ, תרל"ג [1873]. רישום בעלות בדף השער: "חנני ד' בזה, הק' מנדל קרענגיל, פה קראקא, התרמ"א" [הגאון רבי מנחם מנדל קרנגיל מקראקא (תר"ו-תר"צ), מחבר ספרים רבים. נודע בספרו "שם הגדולים השלם – מנחם ציון"].
• קונטרס שאלות ותשובות מן השמים, מאת רבי יעקב הלוי ממרויש ומקורביל, עם פירוש קסת הסופר, מאת רבי אהרן מרקוס. קראקא, תרנ"ה, 1895. בשער נוספה הערה בכתב-יד, על תאריך מותו וקבורתו של מרקוס.
• ספר תקון מדות הנפש על ידי טבע החושים, מאת רבי שלמה אבן גבירול, עם הערות ותיקונים מאת רבי חיים פאללאק. פרשבורג, [תרנ"ו, 1896].
• ספר לשון חסידים, על ספר חסידים, מאת רבי שלמה אהרן וורטהיימר. ירושלים, [תרנ"ח 1898].
• ספר הלקוטים, קובץ מדרשים ישנים ומאמרים שונים, חלק ראשון עד שביעי, בעריכת רבי אלעזר הלוי ד"ר גרינהוט. ירושלים, תרנ"ח-תרס"ג [1898-1903]. שלושה כרכים.
• ארבעה גידולין שאסרו חכמים, מאת מאיר איש שלום. ניו יורק, תרנ"ט, 1899.
• אזהרות לחג השבועות לרבינו אליהו הזקן זצ"ל, בעריכת רבי מרדכי סלוצקי מסוויסלאץ. וורשא, [תר"ס] 1900. הגהה בכתב-יד בדף טז1 (בדף המגן נרשם בכתב-י, בעפרון, כי הגהה זו היא בכתב-ידו של החוקר שלום אלבעק). פתק מודבק על בטנת הכריכה הקדמית, בכתב-ידו של החוקר ישראל דוידזון, המתייחס לספר.
• סדר אליהו רבה וסדר אליהו וזטא, בעריכת רבי מאיר אשי שלום. ווינה, הוצאת חברת אחיאסף, [תרס"ב, 1902]. כרוך עם: נספחים לסדר אליהו זוטא. וינה, הוצאת חברת אחיאסף, [תרס"ד, 1904].
• ספר מכילתא דרבי שמעון בן יוחאי, על ספר שמות, עם הערות ומראה מקומות מאת רבי דוד צבי הופמן. פרנקפורט דמיין, תרס"ה, 1905.
• מדרש תנאים על ספר דברים, בעריכת רבי דוד צבי הופמן, חוברת ראשונה, סדר דברים עד סוף סדר שופטים. ברלין, [תרס"ח, 1908].
• שרידי הירושלמי מן הגניזה אשר במצרים, חלק א', גוף הירושלמי אשר נמצא בהגניזה. ניו יורק, תרס"ט [1909]. בשער המעטפת הקדשת פרופ' "ישראל דאווידזאן" לנחמיה שמואל ליבאוויטש.
• מדרש תנאים על ספר דברים, בעריכת רבי דוד צבי הופמן, חוברת שנייה, סדר כי תצא עד גמירא. ברלין, [תרס"ט, 1909].
• פירוש לקח טוב על מגלת שיר השירים, מרבינו טוביה ב"ר אליעזר ז"ל., יוצא לאור ע"י אלבארט ראינוף. לונדון, [תרס"ט] 1909.
• שערי מוסר השכל, עם משלי חכמים וחידותם. ירושלים, תער"ב [1912].
• סדור תפלה כמנהג אשכנז, עם סדר רב עמרם השלם, ועם הוספות. ירושלים, תרע"ב [1912].
• סדור רב סעדיה גאון, כתאב ג'אמע אלצלואת ואלתסאביח (ספר קובץ התפלות והתושבחות). יוצא לאור על ידי ישראל דודזון ז"ל, שמחה אסף, יששכר יואל. ירושלים, הוצאת מקיצי נרדמים, תש"א, 1941.
• ספר רב שרירא גאון, מאת ד"ר בנימין מנשה לוין. יפו, תרע"ז [1917].
• מרכבה שלמה, ברייתות בתורת הסוד מהתנאים רבי עקיבא ורבי ישמעאל כהן גדול, יוצאים לראשונה מכתב-יד מאוצר ספריו של שלמה מוסאיוב. ירושלים, [תרפ"א, 1921].
• גנזי קדם, מאסף מדעי לתקופת הגאונים, ספר ראשון, שני ושלישי, בעריכת ד"ר בנימין מנשה לוין. חיפה, תרפ"ה-תרפ"ה [1922-1925]. שלושה כרכים.
• דורש רשומות האגדה, באורי אגדות חז"ל על דרך העיון והבקורת, מאת נחמיה שמואל ליבאוויטש. ירושלים, תרפ"ט [1929].
• בית הבחירה, פירוש על פרקי אבות, עם פתיחה גדולה, מאת רבי מנחם המאירי. וינה, [תרי"ד] 1854.
• ספר בית הבחירה, מאת רבינו מנחם המאירי, על מסכתות נדרים נזיר וסוטה. הלברשטאט, [תר"כ, 1860].
• ספר בית הבחירה, על מסכת מכות, מאת רבינו המאירי, בעריכת רבי שמואל וקסמן. ירושלים, תרצ"ז [1937].
• ספר בית הבחירה, על מסכת מקואות, מאת רבינו מנחם המאירי, בעריכת רבי אברהם סופר. ירושלים, ת"ש [1940].
• ספר בית הבחירה, על מסכת עבודה זרה, מאת רבינו מנחם המאירי, בעריכת רבי אברהם סופר. ירושלים, תש"ד, 1944.
• ספר בית הבחירה, על מסכת בבא קמא, מאת רבינו מנחם המאירי, בעריכת רבי קלמן שלזינגר. ירושלים, תש"י [1950].
• ספר הלכות פסוקות לרב יהודאי גאון, יוצאים לאור ע"י רבי סלימאן ששון. ירושלים, הוצאת חברת מקיצי נרדמים, תשי"א, 1950.
כ-50 ספרים, ב-57 כרכים. גודל ומצב משתנים. תווי-ספר. כריכות ישנות ברובן. הספרים לא נבדקו בידינו לעומק, והם נמכרים כמות שהם.
מקור: אוסף פרופ' יצחק ש' פנקובר.
רבים מהספרים באוסף זה הגיעו מאוסף הביבליוגרף נחמיה שמואל ליבוביץ (1862-1939), עם הערות בכתב-ידו, דפים בכתב-ידו, תווי-ספר שונים והקדשות.
